Biology

La skill hugging-science vous aide à trouver et utiliser des ressources d’IA scientifique issues du catalogue Hugging Science et de l’organisation Hugging Face `hugging-science`. Elle convient aux travaux en biologie, chimie, climat, génomique, science des matériaux, astronomie et domaines proches, lorsque vous avez besoin d’un dataset, d’un modèle, d’un Space ou d’un article de blog réellement exploitable ou citable. Utilisez-la pour des workflows d’usage de hugging-science et de guide hugging-science plutôt qu’une recherche générique.

diffdock est un skill de docking pour prédire les poses de liaison protéine-ligand à partir de structures PDB ou de séquences protéiques, avec des ligands en SMILES, SDF ou MOL2. Utilisez le skill diffdock pour la conception de médicaments fondée sur la structure, le criblage virtuel et l’analyse de poses avec score de confiance. Il ne sert pas à prédire l’affinité de liaison.

primekg est un skill de graphe de connaissances PrimeKG pour la recherche académique, reliant gènes, médicaments, maladies, phénotypes et chemins pour une exploration biomédicale fondée sur les preuves et la recherche de repositionnement thérapeutique.

Le skill lamindb vous aide à travailler avec LaminDB, un framework open source pour les données biologiques, conçu pour rendre les données interrogeables, traçables, reproductibles et conformes aux principes FAIR. Utilisez-le pour lamindb dans l’analyse de données, la curation des métadonnées, l’annotation fondée sur des ontologies, la validation de schéma et les workflows sensibles à la lignée des données dans les notebooks et les pipelines.

Skill esm pour les modèles de langage de protéines, avec génération ESM3 et embeddings ESM C. Utilisez ce guide esm pour la conception de séquences protéiques, l’inverse folding, la prédiction de fonction et les workflows de génération de code, avec une inférence locale ou l’API Forge.

depmap aide à analyser le Cancer Dependency Map pour les scores de dépendance des lignées cellulaires cancéreuses, la sensibilité aux médicaments et les profils d’effet génique. Utilisez-le pour repérer des vulnérabilités spécifiques au cancer, des interactions de létalité synthétique et valider des cibles thérapeutiques en oncologie grâce à un guide depmap reproductible pour l’analyse de données.

database-lookup aide à orienter les questions de recherche vers la bonne API de base de données publique et à renvoyer du JSON brut avec le nom des bases sources. Utilisez-le pour les composés, gènes, protéines, variants, essais cliniques, brevets, données environnementales ou indicateurs économiques lorsque vous avez besoin d’un guide de base de données plutôt que d’un résumé web générique.