Biology

hugging-scienceスキルは、Hugging Scienceカタログと `hugging-science` の Hugging Face org から、科学分野のAIリソースを見つけて活用するのに役立ちます。生物学、化学、気候、ゲノム、材料、天文学など、実際に実行・引用できるデータセット、モデル、Space、ブログ記事が必要な場面に向いています。一般的な検索の代わりに、hugging-science の使い方や hugging-science ガイドのワークフローに使ってください。

diffdockは、PDB構造、またはタンパク質配列とSMILES、SDF、MOL2形式のリガンドから、タンパク質-リガンド結合ポーズを予測するドッキングスキルです。構造ベース創薬、バーチャルスクリーニング、信頼度付きポーズ解析にdiffdockスキルを活用できます。結合親和性の予測には対応していません。

primekg は、学術研究向けの PrimeKG 知識グラフ skill です。遺伝子、薬剤、疾患、表現型、経路を結びつけ、エビデンス重視の生物医学探索やドラッグ・リポジショニングに役立ちます。

lamindb スキルは、オープンソースの生物学データ基盤 LaminDB を使いこなすためのものです。データを検索可能・追跡可能・再現可能・FAIR に保ちながら扱えます。Data Analysis における lamindb、メタデータのキュレーション、オントロジーに基づくアノテーション、スキーマ検証、ノートブックやパイプラインをまたぐ系譜を意識したワークフローに活用できます。

ESM3 の生成と ESM C 埋め込みを含む、タンパク質言語モデル向けの esm スキルです。ローカル推論または Forge API を使ったタンパク質配列設計、逆折りたたみ、機能予測、コード生成ワークフローに、この esm ガイドを活用できます。

depmapは、Cancer Dependency Mapを使って、がん細胞株の遺伝子依存性スコア、薬剤感受性、遺伝子効果プロファイルの解析を支援します。がん特異的な脆弱性や合成致死相互作用の特定、オンコロジー創薬ターゲットの検証に活用でき、Data Analysis向けに再現性のあるdepmapガイドとして使えます。

database-lookupは、調査クエリを適切な公開データベースAPIへ振り分け、出典データベース名を添えた生のJSONを返します。化合物、遺伝子、タンパク質、変異、臨床試験、特許、環境データ、経済指標などで、一般的なWeb要約ではなくデータベース参照の道筋が必要なときに使ってください。