Biology

hugging-science 技能可協助你從 Hugging Science 目錄與 `hugging-science` Hugging Face 組織中，找到並使用科學 AI 資源。當你需要能實際執行或引用的資料集、模型、Space 或部落格文章時，它很適合生物、化學、氣候、基因體學、材料、天文學等相關工作。若你的需求是 hugging-science 的使用方式與 hugging-science 指南流程，而不是泛用搜尋，這個技能會更對題。

diffdock 是一個 docking 技能，可根據 PDB 結構，或蛋白質序列搭配以 SMILES、SDF 或 MOL2 表示的配體，預測 protein-ligand 的結合姿勢。可用於結構導向藥物設計、虛擬篩選，以及帶有信心分數的 pose 分析。它不適用於結合親和力預測。

primekg 是一個供學術研究使用的 PrimeKG 知識圖譜技能，可串連基因、藥物、疾病、表型與路徑，支援以證據為導向的生醫探索與藥物再定位。

lamindb 技能可協助你使用 LaminDB——一個開源的生物資料框架，讓資料具備可查詢、可追蹤、可重現與 FAIR 特性。適合用於 lamindb 的資料分析、metadata 整理、基於 ontology 的標註、schema 驗證，以及跨 notebooks 與 pipelines 的 lineage-aware 工作流程。

適用於蛋白質語言模型的 esm 技能，涵蓋 ESM3 生成與 ESM C embeddings。可用這份 esm 指南進行蛋白質序列設計、逆摺疊、功能預測，以及透過本地推論或 Forge API 執行 code generation 工作流程。

depmap 可協助分析 Cancer Dependency Map，取得癌症細胞株的基因依賴分數、藥物敏感性與基因效應輪廓。可用來找出癌症特異性脆弱點、合成致死交互作用，並透過可重現的 depmap 指南驗證腫瘤學藥物標的，適合 Data Analysis 使用。

database-lookup 可將研究問題導向正確的公開資料庫 API，並回傳附上來源資料庫名稱的原始 JSON。當你需要的是資料庫查找指南，而不是一般網頁摘要時，可用於化合物、基因、蛋白質、變異、臨床試驗、專利、環境資料或經濟指標等查詢。