Chemistry

rdkit 技能可協助你精準處理化學資訊工作流程：解析 SMILES、SDF、MOL、PDB 與 InChI；計算描述子；產生指紋；執行子結構搜尋；處理反應；以及建立 2D/3D 座標。這份 rdkit 指南適合進階控制、自訂清理，以及用 rdkit 進行 Data Analysis 工作流程。

hugging-science 技能可協助你從 Hugging Science 目錄與 `hugging-science` Hugging Face 組織中，找到並使用科學 AI 資源。當你需要能實際執行或引用的資料集、模型、Space 或部落格文章時，它很適合生物、化學、氣候、基因體學、材料、天文學等相關工作。若你的需求是 hugging-science 的使用方式與 hugging-science 指南流程，而不是泛用搜尋，這個技能會更對題。

pymatgen 是一套用於晶體結構、相圖、電子結構與檔案轉換的 Python 材料科學工具組。這個 pymatgen 技能可協助處理包含 CIF、POSCAR、VASP 與 Materials Project 資料的科學工作流程。

molfeat 是一個用於 ML 與資料分析的分子特徵化技能。它可將 SMILES 或 RDKit 分子轉成 fingerprint、descriptor 與預訓練 embedding，適合 QSAR、虛擬篩選、相似度搜尋與化學空間分析。可用這份 molfeat 指南挑選實用表示法，並建立可重用的特徵化流程。

medchem 是一個用於 Scientific 工作流程的藥物化學篩選技能。可用來套用 Lipinski、Veber、PAINS、結構警示與複雜度指標，進行化合物優先排序、資料庫清理、先導化合物最佳化與化合物品質審查。

database-lookup 可將研究問題導向正確的公開資料庫 API，並回傳附上來源資料庫名稱的原始 JSON。當你需要的是資料庫查找指南，而不是一般網頁摘要時，可用於化合物、基因、蛋白質、變異、臨床試驗、專利、環境資料或經濟指標等查詢。