Biology

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7 个技能
K
hugging-science

作者 K-Dense-AI

hugging-science 技能可帮助你从 Hugging Science 目录和 `hugging-science` 这个 Hugging Face 组织中查找并使用科学 AI 资源。它适用于生物学、化学、气候、基因组学、材料、天文学以及类似场景,尤其是在你需要一个可以真正运行或引用的数据集、模型、Space 或博客文章时。请在 hugging-science 的使用与 hugging-science 指南工作流中使用它,而不是只靠通用搜索。

科学
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K
diffdock

作者 K-Dense-AI

diffdock 是一项对接技能,可基于 PDB 结构,或蛋白序列加上以 SMILES、SDF、MOL2 表示的配体,预测蛋白-配体结合构象。适用于基于结构的药物设计、虚拟筛选以及带置信度评分的构象分析。它不用于结合亲和力预测。

数据分析
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K
primekg

作者 K-Dense-AI

primekg 是面向学术研究的 PrimeKG 知识图谱技能,可关联基因、药物、疾病、表型和路径,用于以证据为导向的生物医学探索和药物再利用研究。

学术研究
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K
lamindb

作者 K-Dense-AI

lamindb 技能可帮助你使用 LaminDB —— 一个开源的生物学数据框架,让数据可查询、可追溯、可复现并符合 FAIR 原则。它适用于 lamindb 的数据分析、元数据整理、基于本体的注释、schema 验证,以及贯穿 notebooks 和 pipelines 的可追踪工作流。

数据分析
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esm

作者 K-Dense-AI

用于蛋白质语言模型的 esm 技能,涵盖 ESM3 生成和 ESM C embeddings。可将这份 esm 指南用于蛋白序列设计、逆折叠、功能预测以及在本地推理或 Forge API 下的代码生成工作流。

代码生成
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K
depmap

作者 K-Dense-AI

depmap 可帮助分析 Cancer Dependency Map 中癌症细胞系的基因依赖性评分、药物敏感性和基因效应谱。可用于识别癌症特异性脆弱点、合成致死相互作用,并借助可复现的 depmap 指南验证肿瘤学药物靶点,适用于 Data Analysis。

数据分析
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K
database-lookup

作者 K-Dense-AI

database-lookup 可将研究问题分流到合适的公共数据库 API,并返回带来源数据库名称的原始 JSON。适用于化合物、基因、蛋白质、变体、临床试验、专利、环境数据或经济指标等场景,尤其是在你需要的是 database-lookup 指南,而不是泛泛的网页摘要时。

Web 研究
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