蛋白质

diffdock 是一项对接技能，可基于 PDB 结构，或蛋白序列加上以 SMILES、SDF、MOL2 表示的配体，预测蛋白-配体结合构象。适用于基于结构的药物设计、虚拟筛选以及带置信度评分的构象分析。它不用于结合亲和力预测。

molecular-dynamics 技能帮助你使用 OpenMM 和 MDAnalysis 为 Scientific workflows 搭建、运行并分析分子动力学模拟。可用于蛋白稳定性、配体结合、构象采样，以及 RMSD、RMSF、接触图和自由能面等轨迹分析。它侧重于实用的搭建、力场选择和可复现执行。

使用 glycoengineering 技能分析并设计蛋白质糖基化。可识别 N-glycosylation 序列位点，估算 O-glycosylation 热点，并为抗体优化、疫苗设计以及面向 Data Analysis 工作流的 glycoengineering 提供实用的决策指导。

用于蛋白质语言模型的 esm 技能，涵盖 ESM3 生成和 ESM C embeddings。可将这份 esm 指南用于蛋白序列设计、逆折叠、功能预测以及在本地推理或 Forge API 下的代码生成工作流。

adaptyv 可帮助你使用 Adaptyv Bio Foundry API 和 Python SDK 来安装、提交蛋白质序列并检索检测结果。将这个 adaptyv 技能用于 API 开发、认证配置、请求构造，以及关于 binding、screening、thermostability、expression 和 fluorescence 工作流的实用指导。