Biology

Die hugging-science-Skill hilft dir, wissenschaftliche KI-Ressourcen aus dem Hugging Science-Katalog und der Hugging-Face-Organisation `hugging-science` zu finden und zu nutzen. Sie passt zu Biologie, Chemie, Klima, Genomik, Materialwissenschaften, Astronomie und ähnlichen Aufgaben, wenn du einen Datensatz, ein Modell, einen Space oder einen Blogbeitrag suchst, den du tatsächlich ausführen oder zitieren kannst. Nutze sie für hugging-science-Nutzung und hugging-science-Guide-Workflows statt für eine allgemeine Suche.

diffdock ist ein Docking-Skill zur Vorhersage von Protein-Ligand-Bindungsposen aus PDB-Strukturen oder aus Proteinsequenzen plus Liganden in SMILES, SDF oder MOL2. Verwenden Sie den diffdock Skill für structure-based drug design, virtuelles Screening und Posenanalyse mit Konfidenzwertung. Er ist nicht für die Vorhersage der Bindungsaffinität gedacht.

primekg ist ein PrimeKG-Wissensgraph-Skill für die akademische Forschung, der Gene, Medikamente, Krankheiten, Phänotypen und Pfade verknüpft, um evidenzorientierte biomedizinische Analysen und Drug Repurposing zu unterstützen.

Die lamindb-Skill hilft dir bei der Arbeit mit LaminDB, einem Open-Source-Framework für biologische Daten, das Daten abfragbar, nachvollziehbar, reproduzierbar und FAIR macht. Nutze sie für lamindb bei der Datenanalyse, Metadatenkuratierung, ontologiebasierten Annotation, Schema-Validierung und lineage-bewussten Workflows in Notebooks und Pipelines.

esm-Skill für Proteinsprachmodelle, einschließlich ESM3-Generierung und ESM C-Embeddings. Verwenden Sie diesen esm-Leitfaden für Proteinsequenzdesign, inverses Folding, Funktionsvorhersage und Codegenerierungs-Workflows mit lokaler Inferenz oder der Forge API.

depmap unterstützt die Analyse der Cancer Dependency Map für Gen-Dependency-Scores von Krebszelllinien, Arzneimittel-Empfindlichkeit und Gene-Effect-Profile. Nutzen Sie es, um krebsspezifische Schwachstellen, synthetisch-letale Interaktionen und validierte Wirkstoffziele in der Onkologie mit einem reproduzierbaren depmap-Leitfaden für Data Analysis zu identifizieren.

database-lookup hilft dabei, Recherchefragen an die passende öffentliche Datenbank-API weiterzuleiten und rohes JSON samt benannter Quelldatenbanken zurückzugeben. Nutze es für Verbindungen, Gene, Proteine, Varianten, klinische Studien, Patente, Umweltdaten oder Wirtschaftsindikatoren, wenn du statt einer allgemeinen Web-Zusammenfassung einen Leitfaden für die Datenbanksuche brauchst.