Chemistry

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6 Skills
K
rdkit

von K-Dense-AI

Die rdkit-Skill unterstützt präzise Cheminformatik-Workflows: SMILES, SDF, MOL, PDB und InChI parsen, Deskriptoren berechnen, Fingerprints erzeugen, Substruktursuche ausführen, Reaktionen handhaben und 2D-/3D-Koordinaten erstellen. Verwenden Sie diesen rdkit-Leitfaden für erweiterte Kontrolle, benutzerdefinierte Sanitization und rdkit für Data-Analysis-Workflows.

Data Analysis
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K
hugging-science

von K-Dense-AI

Die hugging-science-Skill hilft dir, wissenschaftliche KI-Ressourcen aus dem Hugging Science-Katalog und der Hugging-Face-Organisation `hugging-science` zu finden und zu nutzen. Sie passt zu Biologie, Chemie, Klima, Genomik, Materialwissenschaften, Astronomie und ähnlichen Aufgaben, wenn du einen Datensatz, ein Modell, einen Space oder einen Blogbeitrag suchst, den du tatsächlich ausführen oder zitieren kannst. Nutze sie für hugging-science-Nutzung und hugging-science-Guide-Workflows statt für eine allgemeine Suche.

Scientific
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K
pymatgen

von K-Dense-AI

pymatgen ist ein Python-Toolkit für Materialwissenschaften für Kristallstrukturen, Phasendiagramme, elektronische Struktur und Dateikonvertierung. Diese pymatgen-Skill hilft bei wissenschaftlichen Workflows mit CIF, POSCAR, VASP und Daten aus dem Materials Project.

Scientific
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K
molfeat

von K-Dense-AI

molfeat ist eine Skill für molekulare Featurisierung für ML und Data Analysis. Sie hilft dabei, SMILES oder RDKit-Moleküle in Fingerprints, Deskriptoren und vortrainierte Embeddings zu überführen – für QSAR, Virtual Screening, Similarity Search und die Analyse des chemischen Raums. Nutzen Sie diesen molfeat-Guide, um passende Repräsentationen auszuwählen und wiederverwendbare Featurization-Pipelines aufzubauen.

Data Analysis
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K
medchem

von K-Dense-AI

medchem ist ein Skill für das Filtern nach medizinischer Chemie in Scientific-Workflows. Nutzen Sie ihn, um Lipinski, Veber, PAINS, strukturelle Warnhinweise und Komplexitätsmetriken für die Priorisierung von Verbindungen, die Bereinigung von Bibliotheken, Lead-Optimierung und die Qualitätsprüfung von Verbindungen anzuwenden.

Scientific
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K
database-lookup

von K-Dense-AI

database-lookup hilft dabei, Recherchefragen an die passende öffentliche Datenbank-API weiterzuleiten und rohes JSON samt benannter Quelldatenbanken zurückzugeben. Nutze es für Verbindungen, Gene, Proteine, Varianten, klinische Studien, Patente, Umweltdaten oder Wirtschaftsindikatoren, wenn du statt einer allgemeinen Web-Zusammenfassung einen Leitfaden für die Datenbanksuche brauchst.

Web Research
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Chemistry